Nierzetelnie prowadzona księga to kolejny problem, z którym bardzo często borykają się przedsiębiorcy. Księgi nierzetelne to takie księgi, w których znajdujące się zapisy niestety nie odpowiadają stanowi rzeczywistemu. Zatem za nierzetelnie prowadzoną księgę będzie uznana taka, która nie będzie w stanie udokumentować rzeczywistych zdarzeń księgowych. Wśród przykładów takich zdarzeń wymienić należy kwestie takie jak na przykład niewpisanie faktury. Nierzetelnością może także zostać uznany brak dowodu, który stanowi podstawę wpisu do takiej księgi.
W zasadzie można powiedzieć, że księgi podatkowe mogą zostać uznane za prowadzone w sposób nierzetelny nie tylko wówczas, kiedy ich po ich przeanalizowaniu okaże się, że istnieją sprzeczności w zakresie poszczególnych składników działalności gospodarczej. Może do tego dojść także wtedy, kiedy poszczególne składniki tej działalności będą znacznie różniły się od przeciętnych wartości tych składników w podobnych przedsiębiorstwach. Przykładem takiej sytuacji może być fakt, kiedy na przykład marża handlowa analizowanego przedsiębiorstwa będzie rażąco odbiegała od standardowych marż, które są osiągane w danej branży w innych przedsiębiorstwach.