Podatnikami są również osoby prawne, jednostki organizacyjne nie mające osobowości prawnej i osoby fizyczne o ile ciąży na nich obowiązek uiszczenia cła, również w przypadku, gdy na podstawie odrębnych przepisów celnych importowany towar jest zwolniony od cła albo cło na ten towar zostało zawieszone w części lub całości albo zastosowano preferencyjna, obniżoną stawkę celną.
Jeśli osoby prawne, jednostki organizacyjne nie posiadające osobowości prawnej lub osoby fizyczne uprawnione są do korzystania z procedury celnej obejmującej uszlachetnienie czynne, odprawę czasową, przetworzenie pod kontrolą celną, są również podatnikami podatku od towaru i usług.  Podatnikami są także osoby, na które zgodnie z odrębnymi  przepisami przeniesiono prawa i obowiązki wynikające ze sprawowania kontroli celnej.
Do grona podatników podatku VAT zaliczymy także osoby prawne, jednostki organizacyjne i osoby fizyczne, które dokonują wewnątrzwspólnotowego nabycia towarów albo też są usługobiorcami usług świadczonych przez przedsiębiorców nie posiadających siedziby, miejsca stałego zamieszkania lub stałego miejsca prowadzenia swojej działalności gospodarczej.